Melbourne Victory og Chris Iconomidis ga Manchester United en overraskelse i åpningsminuttene, men Premier League-klubben vant 4-1 etter snuoperasjonen.
Melbourne Victory stoppet de engelske gigantene da Chris Ikonomidis førte australierne foran etter bare fem minutter.
Scott McTominay utlignet fra 20 meter fire minutter før pause, før Anthony Martial førte England i ledelsen tre minutter senere.
Manchester United erstattet hele laget ved pause bortsett fra Tom Heaton i mål, en mye tregere første med færre sjanser.
Manchester-klubben kom seg til slutt da Marcus Rashford ble stående en-mot-en med Paul Izzo for første gang i Melbourne-målet for de rødes tredje for dagen, før Melbournes Edmond Lupancu scoret et selvmål.
Den nye Manchester United-manageren Erik ten Hag gjorde tre endringer i startoppstillingen fra tirsdagens 4-0-seier over Liverpool. Tom Heaton, Harry Maguire og Anthony Elanga erstattet David de Gea, Raphael Varane og Marcus Rashford.